Evangelion: 3.33 You Can (not) Redo Tỉnh dậy từ cỗ máy Unit-01, Shinji Ikari bàng hoàng. Cậu sống sót, nhưng ký ức mờ nhạt, thế giới thì hoàn toàn đổi khác sau thảm họa kinh hoàng. Mọi thứ trở nên xa lạ, những gương mặt thân quen một thời giờ lại nhìn cậu bằng ánh mắt nghi ngờ, thậm chí coi cậu là tội đồ.
Shinji không thể chấp nhận sự im lặng. Cậu phải hiểu chuyện gì đã xảy ra, đâu là sự thật đằng sau những thay đổi chóng mặt này. Hơn thế nữa, cậu không thể quên Rei Ayanami, người đã cùng cậu chiến đấu. Quyết tâm bảo vệ cô bạn đồng hành, Shinji dấn thân vào cuộc hành trình tìm kiếm sự thật và giải cứu.
Nhưng cuộc đời trớ trêu. Hành trình của Shinji càng thêm khó khăn khi cậu bị tước quyền lái Eva, con tàu chiến bảo vệ thế giới. Nơi ở mới, không còn là căn cứ NERV quen thuộc. Những bí ẩn, những âm mưu chồng chất, tương lai mù mịt. Liệu Shinji có thể vượt qua tất cả, vén màn bí mật và tìm lại bình yên? Hay cậu sẽ mãi mãi lạc lõng giữa thế giới đầy rẫy bất trắc này?